More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3532 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3532  transport system permease protein  100 
 
 		 235 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  60.23 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0306  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  49.02 
 
 		 350 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10160  ferric enterobactin transport protein FepD  61.21 
 
 		 340 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0016497  normal  0.782861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1805  transport system permease protein  58.68 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  56.07 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1630  transport system permease protein  48.06 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  50 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  47.4 
 
 		 350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  52.41 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  45.13 
 
 		 351 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44 
 
 		 351 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  44.75 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  44.21 
 
 		 347 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  50.9 
 
 		 334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  43.18 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  45.83 
 
 		 341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.39 
 
 		 374 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  40.86 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  44.13 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.97 
 
 		 368 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  48.5 
 
 		 353 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  46.67 
 
 		 353 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  45 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.22 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  45.9 
 
 		 347 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  39.9 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.79 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  41.21 
 
 		 340 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  47.95 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  44.39 
 
 		 351 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  44.05 
 
 		 342 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  38.83 
 
 		 331 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  38.83 
 
 		 331 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  40.64 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  41.04 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  41.04 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 334 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  36.81 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  35.05 
 
 		 340 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  35.05 
 
 		 340 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  37.95 
 
 		 329 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  35.05 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  40.32 
 
 		 336 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  36.81 
 
 		 334 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  35.05 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  39.04 
 
 		 348 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  41.77 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  43.72 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  37.81 
 
 		 350 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  43.71 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  48.54 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  47.2 
 
 		 347 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  47.98 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  43.61 
 
 		 352 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  46.96 
 
 		 364 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  43.71 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  47.34 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  45.24 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.91 
 
 		 342 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  41.58 
 
 		 344 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  38.01 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  37.43 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.36 
 
 		 339 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  45.2 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.24 
 
 		 346 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  37.28 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  44.51 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.56 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  38.38 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0139  iron-siderophore ABC transporter, membrane permease component  40.36 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  44.44 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55020  ABC transporter permease  38.46 
 
 		 340 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520713  unclonable  2.14331e-21 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.11 
 
 		 355 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  36.9 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  44.51 
 
 		 366 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 351 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  37.75 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  36.87 
 
 		 351 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 351 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  46.15 
 
 		 363 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 351 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  41.32 
 
 		 337 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  49.73 
 
 		 344 aa  95.5  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.08 
 
 		 351 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.08 
 
 		 351 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 351 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  36.87 
 
 		 350 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  43.9 
 
 		 366 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1394  iron compound ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 		 341 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.591622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1492  putative ferrichrome transport system permease protein  46.99 
 
 		 343 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  39.74 
 
 		 325 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.98 
 
 		 335 aa  92.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  44.38 
 
 		 334 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.38 
 
 		 334 aa  92  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>