54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2116 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 		 138 aa  268  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  48.48 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  45.97 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  45.76 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  38.85 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.09 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.59 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  39.57 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.24 
 
 		 355 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  35.71 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  35 
 
 		 281 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.43 
 
 		 360 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.45 
 
 		 358 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.54 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  33.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.52 
 
 		 366 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  33.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.71 
 
 		 232 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.9 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.71 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1098  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.24 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.95 
 
 		 246 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  32.26 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  31.75 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  34.43 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.59 
 
 		 370 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  31.93 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.08 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  39.13 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.63 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.16 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.61 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  33.33 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.23 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.63 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.23 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.23 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.96 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.06 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  30.16 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  34.13 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  39.33 
 
 		 8064 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.48 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  35.96 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  39.33 
 
 		 6310 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.7 
 
 		 347 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.75 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  41.38 
 
 		 324 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  33.04 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>