106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1801 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
241 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  55.05 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.42 
 
 
227 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  54.55 
 
 
227 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.55 
 
 
227 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  51.12 
 
 
227 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  50.65 
 
 
235 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  49.74 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  43.81 
 
 
235 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.98 
 
 
235 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  40.89 
 
 
236 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  40.89 
 
 
236 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.22 
 
 
235 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
235 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  43.92 
 
 
257 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.89 
 
 
240 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.39 
 
 
236 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  39.06 
 
 
245 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  45.26 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  44.21 
 
 
241 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.21 
 
 
241 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  44.21 
 
 
241 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.03 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.79 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.53 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.47 
 
 
256 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  33.65 
 
 
275 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.35 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.23 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.19 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  26.36 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  28.86 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  29.32 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  24.42 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  23.74 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  27.11 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.33 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  28.93 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  27.11 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  26.36 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  38.6 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  24.87 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  21.96 
 
 
284 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  27.27 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  28.1 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  24.59 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  36.84 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  44.44 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  27.05 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  21.76 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  34.92 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  21.58 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  26.13 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  24.89 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  33.33 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  21.69 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  35.09 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  35.09 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  42.59 
 
 
296 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  35.09 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  34.55 
 
 
289 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  22.51 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  24.43 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  22.57 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  21.16 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  23.47 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  21.43 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  33.33 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  21.16 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  21.37 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  35.19 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.56 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  30.3 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  21.62 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  32.76 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  34.38 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  23.08 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  31.03 
 
 
318 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  38.18 
 
 
519 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>