35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0006 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0054  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0053  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0006  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00260818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00716985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0005  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0006  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0598  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0660  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60300  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61760  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486139  hitchhiker  0.00483017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t54  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0869713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna3  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>