More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2418 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2099  translation initiation factor 3  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000973621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2418  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000103709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2137  translation initiation factor IF-3  86.83 
 
 		 167 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194801  hitchhiker  0.00234339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  61.21 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  61.21 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  61.21 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  61.21 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  59.39 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  59.39 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  59.39 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  58.06 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 173 aa  183  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  55.48 
 
 		 184 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2596  translation initiation factor IF-3  56.36 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000880416  hitchhiker  0.000575086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  53.66 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 180 aa  177  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 159 aa  176  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  53.33 
 
 		 225 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 193 aa  175  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  54.22 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  54.22 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  54.22 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  54.22 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  54.22 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  52.2 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  61.19 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.2 
 
 		 174 aa  173  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 186 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  51.5 
 
 		 243 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  52.56 
 
 		 156 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 194 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  53.21 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 194 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.69 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 230 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 232 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 194 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1713  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.9 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>