125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2213 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2213  exonuclease  100 
 
 
242 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1767  exodeoxyribonuclease X, putative  32.43 
 
 
220 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1442  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.43 
 
 
220 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0697655  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.68 
 
 
218 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3657  putative DNA exonuclease X  31.47 
 
 
224 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.84 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.84 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  25 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  25.24 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  26.24 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  25 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0559  exonuclease  25.33 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  26.24 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  26.97 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  26.24 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1066  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.25 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.327766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  24.58 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1938  exodeoxyribonuclease X  25.93 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.652538  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  24.58 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.79 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.27 
 
 
502 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
453 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  25.79 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.66 
 
 
530 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.11 
 
 
476 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2415  exodeoxyribonuclease X  27.27 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1790  exonuclease  25.31 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.72 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  28.27 
 
 
530 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 
921 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.98 
 
 
463 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.99 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 
392 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  29 
 
 
462 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.74 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.4 
 
 
375 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
470 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.4 
 
 
375 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.45 
 
 
466 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  30.72 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.74 
 
 
246 aa  48.9  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.31 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.3 
 
 
565 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  26.95 
 
 
379 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.75 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  29.01 
 
 
168 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.71 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  31.98 
 
 
170 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.42 
 
 
659 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  27.81 
 
 
299 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.75 
 
 
715 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.49 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.47 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0908  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.52 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.65 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  28.81 
 
 
611 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.78 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.85 
 
 
482 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.38 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  26.51 
 
 
315 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00003917  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000879357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2063  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000471549  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  32.77 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  26.7 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.76 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.88 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.23 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.76 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.76 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.09 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.53 
 
 
547 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  25.9 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.06 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  25.9 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.29 
 
 
532 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 
714 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  26.37 
 
 
630 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.06 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  25.9 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.23 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  29.41 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  26.37 
 
 
630 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>