72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2141 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2141  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1852  hypothetical protein  94.19 
 
 
159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.943704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2179  hypothetical protein  62.94 
 
 
163 aa  189  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.780072  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  33.62 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  38.82 
 
 
104 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  34.12 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  38.82 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  39.51 
 
 
104 aa  51.2  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  31.46 
 
 
111 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  37.31 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  29.06 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  35.62 
 
 
122 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  34.25 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  34.25 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  34.25 
 
 
120 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  32.95 
 
 
107 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  29.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2361  hypothetical protein  40.7 
 
 
103 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  40.7 
 
 
103 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  32.88 
 
 
122 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  40.7 
 
 
103 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  35.29 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  32.14 
 
 
106 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  32.94 
 
 
106 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  32.94 
 
 
106 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  32.94 
 
 
106 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  34.33 
 
 
122 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  31.88 
 
 
126 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  32.98 
 
 
105 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  44.7  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  30.95 
 
 
108 aa  44.3  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  32.94 
 
 
106 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  30.95 
 
 
109 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  28.28 
 
 
105 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  29.41 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  29.29 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0819  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186166  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  26.67 
 
 
105 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  32.14 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  34.12 
 
 
108 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  32.14 
 
 
100 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  36.23 
 
 
123 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  30.95 
 
 
105 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  30.59 
 
 
104 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  30.59 
 
 
106 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  29.29 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  29.25 
 
 
111 aa  41.2  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  32.53 
 
 
141 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  29.76 
 
 
106 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>