43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1941 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  79.07 
 
 
172 aa  281  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  62.6 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  58.52 
 
 
152 aa  181  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  57.81 
 
 
148 aa  170  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  58.18 
 
 
131 aa  154  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  42.97 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  41.94 
 
 
179 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  48.18 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  37.66 
 
 
306 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  47.66 
 
 
133 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 
270 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  36.64 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  43.65 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  43.2 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  43.93 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  44.7 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  38.58 
 
 
154 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  39.37 
 
 
150 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  42.75 
 
 
168 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  38.93 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  38.58 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  29.08 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  40.86 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  34.86 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  34.86 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  34.86 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  36.51 
 
 
132 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  32.73 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  31.03 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  41.89 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  35.16 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  40.48 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  29.63 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  38.75 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  47.69 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  31.19 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>