23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0779 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0779  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.128656  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  96.89 
 
 
193 aa  388  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  64.4 
 
 
195 aa  269  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  27.71 
 
 
175 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  24.14 
 
 
169 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  25.31 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  24.69 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  23.6 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  25.15 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  28 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  24.84 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  22.7 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  24.84 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  27.33 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  28.75 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  28 
 
 
159 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  31.08 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  28.31 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  25.27 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  21.12 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  23.89 
 
 
171 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>