128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0315 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1465  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.38 
 
 
740 aa  936    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00781151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4012  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.33 
 
 
741 aa  957    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1354  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.61 
 
 
741 aa  1061    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2897  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.92 
 
 
743 aa  978    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0635  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.44 
 
 
734 aa  747    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.707304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2629  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.84 
 
 
741 aa  985    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3356  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.14 
 
 
743 aa  960    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3186  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  63.01 
 
 
740 aa  971    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467142  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0287  isocitrate dehydrogenase  94.72 
 
 
739 aa  1465    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3120  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  73.74 
 
 
745 aa  1152    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4201  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  72.22 
 
 
747 aa  1122    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3594  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  62.87 
 
 
741 aa  969    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.942271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5855  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  60.9 
 
 
742 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0781482  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0459  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  59.89 
 
 
741 aa  932    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1410  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  60.16 
 
 
741 aa  940    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1359  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  59.97 
 
 
740 aa  927    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000634164  hitchhiker  8.074690000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1101  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.27 
 
 
739 aa  961    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1047  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  53.18 
 
 
729 aa  807    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2227  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.7 
 
 
743 aa  944    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2203  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.08 
 
 
739 aa  899    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.199816  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2371  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.84 
 
 
731 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0872233  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1684  isocitrate dehydrogenase (NADP+)  61.74 
 
 
742 aa  965    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000025647  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0532  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent, monomeric type  62.01 
 
 
742 aa  961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1831  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.44 
 
 
740 aa  978    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.774798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0525  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.01 
 
 
744 aa  964    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0755459  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0315  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 
739 aa  1541    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.789094  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3729  isocitrate dehydrogenase  72.76 
 
 
747 aa  1129    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0477  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.87 
 
 
738 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1912  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.6 
 
 
742 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1209  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.92 
 
 
750 aa  1045    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.766417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2377  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.03 
 
 
743 aa  1056    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00123907  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1641  isocitrate dehydrogenase  58.81 
 
 
737 aa  899    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1606  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.66 
 
 
741 aa  999    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.601658  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1681  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.66 
 
 
741 aa  999    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.642711  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1121  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.31 
 
 
744 aa  986    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2257  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.44 
 
 
741 aa  974    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2571  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.04 
 
 
742 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30180  monomeric isocitrate dehydrogenase  66.4 
 
 
741 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1092  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.81 
 
 
740 aa  915    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2523  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.6 
 
 
742 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0065836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1603  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.46 
 
 
742 aa  897    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213758  normal  0.272046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1750  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.66 
 
 
741 aa  997    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.307688  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0913  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.42 
 
 
730 aa  763    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.280691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0680  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.79 
 
 
741 aa  960    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3575  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.1 
 
 
737 aa  871    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2059  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  61.42 
 
 
741 aa  940    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1226  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.92 
 
 
750 aa  1045    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.980555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0983  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.84 
 
 
742 aa  938    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.614065  normal  0.0628792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3212  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.35 
 
 
746 aa  1053    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0090  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.54 
 
 
747 aa  1010    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0350175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3680  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  73 
 
 
745 aa  1142    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2300  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  75.82 
 
 
744 aa  1187    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288016  hitchhiker  0.00925586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0624  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  72.42 
 
 
745 aa  1120    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0556  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.57 
 
 
767 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2475  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.93 
 
 
741 aa  981    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00185423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1236  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.12 
 
 
745 aa  1049    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1563  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.17 
 
 
739 aa  989    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.37594  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3455  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.2 
 
 
749 aa  1043    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0243949  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0366  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  72.38 
 
 
744 aa  1113    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2230  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.93 
 
 
741 aa  984    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2397  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.76 
 
 
742 aa  1023    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.942581  normal  0.0892636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2181  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.62 
 
 
740 aa  918    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0711  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent, monomeric type  63.3 
 
 
741 aa  962    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2194  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.25 
 
 
743 aa  958    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000647255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1821  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.33 
 
 
767 aa  957    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.111465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2086  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  86.33 
 
 
739 aa  1357    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2087  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.37 
 
 
740 aa  986    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10066  isocitrate dehydrogenase [NADP] icd2  72.42 
 
 
745 aa  1121    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.655644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3267  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.5 
 
 
740 aa  964    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2583  NADP-dependent isocitrate dehydrogenase  66.26 
 
 
741 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2468  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.93 
 
 
741 aa  980    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00290005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.62 
 
 
744 aa  933    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1399  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.57 
 
 
767 aa  747    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1135  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.77 
 
 
732 aa  764    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01563  socitrate dehydrogenase  62.48 
 
 
741 aa  952    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06770  isocitrate dehydrogenase (NADP)  62.57 
 
 
738 aa  957    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1883  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  62.02 
 
 
741 aa  956    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.615158  decreased coverage  0.0000000395954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2535  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.18 
 
 
740 aa  974    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4274  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.92 
 
 
739 aa  897    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876075  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1986  monomeric isocitrate dehydrogenase  50.75 
 
 
722 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.305088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2588  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.8 
 
 
741 aa  982    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.540941  normal  0.0688936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3645  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  75 
 
 
744 aa  1178    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000734043  normal  0.208006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0771  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.19 
 
 
741 aa  951    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318617  hitchhiker  0.000000506151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3617  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.06 
 
 
741 aa  937    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.162405  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3416  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.65 
 
 
741 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2702  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.39 
 
 
740 aa  968    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.0232345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2548  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.6 
 
 
742 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00891697  hitchhiker  0.0000000308445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2249  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  58.45 
 
 
743 aa  915    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4382  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  73.5 
 
 
745 aa  1131    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000594787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0369  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  71.97 
 
 
744 aa  1103    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2442  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.04 
 
 
742 aa  937    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000648853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3132  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.09 
 
 
741 aa  937    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2159  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.9 
 
 
743 aa  910    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5456  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  72.09 
 
 
747 aa  1116    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897377  normal  0.0127926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4080  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.06 
 
 
742 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03994  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.38 
 
 
743 aa  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0694  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.35 
 
 
746 aa  843    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00369778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0553  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.52 
 
 
741 aa  950    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1624  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.65 
 
 
742 aa  959    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00119638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0799  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.92 
 
 
739 aa  979    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>