66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2288 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1396  hypothetical protein  54.24 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0839  HNH endonuclease  54.76 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1668  HNH endonuclease  54.62 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.843444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3163  hypothetical protein  58.04 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1362  hypothetical protein  52.8 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4107  hypothetical protein  53.57 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1778  hypothetical protein  53.39 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.539869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1305  hypothetical protein  53.57 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2740  hypothetical protein  57.39 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4584  hypothetical protein  53.57 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1506  hypothetical protein  57.39 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3893  hypothetical protein  53.57 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1442  hypothetical protein  58.26 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1572  hypothetical protein  54.46 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.0102998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3913  hypothetical protein  54.46 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.779122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1577  hypothetical protein  57.39 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1543  hypothetical protein  57.39 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2803  hypothetical protein  57.39 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.667341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1547  hypothetical protein  57.39 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1709  hypothetical protein  53.57 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2551  hypothetical protein  56.52 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2718  hypothetical protein  56.52 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2618  hypothetical protein  56.52 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1176  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1363  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1061  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1738  hypothetical protein  56.52 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17990  HNH endonuclease domain-containing protein  58.25 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1298  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0247064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1881  hypothetical protein  50.82 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1697  hypothetical protein  53.1 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.753726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1247  hypothetical protein  57 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2451  HNH endonuclease  51.82 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449556  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2881  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1349  hypothetical protein  48.67 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.0379212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3445  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1378  hypothetical protein  49.56 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3298  hypothetical protein  48.7 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.989077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2803  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2455  hypothetical protein  47.83 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0451  hypothetical protein  48.7 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0448  hypothetical protein  48.7 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0329  hypothetical protein  47.83 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.443083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0468  hypothetical protein  48.7 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0457  hypothetical protein  48.7 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0511  hypothetical protein  48.7 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3688  hypothetical protein  52.04 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0492  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.788457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0480  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00362  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.308239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0444  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3223  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  hitchhiker  0.00000116021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0440  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00358  hypothetical protein  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3199  HNH endonuclease  51.92 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00688209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1678  hypothetical protein  47.79 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0922  HNH endonuclease  52.03 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2881  HNH endonuclease  58.18 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0691  HNH endonuclease  57.78 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000791795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0702  HNH endonuclease  57.78 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000397856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2816  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0915  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3568  HNH endonuclease  52.22 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1211  hypothetical protein  61.54 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0661849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1250  HNH endonuclease  56.63 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>