20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0879 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0879  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000121111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1337  hypothetical protein  68.82 
 
 
93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.40262e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2050  hypothetical protein  36.56 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0825138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0108  hypothetical protein  41.25 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2144  diverged CheY-domain-containing protein  36.96 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.14206 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0407  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0636  hypothetical protein  33.71 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000271066  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1272  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19578  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1386  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00404219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0266  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.435874  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1575  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1013  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0920  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.75 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000698325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1931  hypothetical protein  38.75 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0969156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2793  diverged CheY-domain protein  34.94 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000829649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1950  diverged CheY-domain  32.95 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0619  hypothetical protein  34.88 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120205  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0574  hypothetical protein  33.73 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2586  hypothetical protein  32.26 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0346  hypothetical protein  31.25 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0228495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>