More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1162 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1162  dihydropteroate synthase  100 
 
 
300 aa  599  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0343  dihydropteroate synthase  76.61 
 
 
299 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1782  dihydropteroate synthase  75.34 
 
 
310 aa  472  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.585342 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1313  dihydropteroate synthase  74.57 
 
 
300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0586375  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1468  dihydropteroate synthase  42.37 
 
 
418 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1570  dihydropteroate synthase  36.77 
 
 
281 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0184  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
303 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.875168  normal  0.154006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  32.74 
 
 
270 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  34.15 
 
 
400 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2314  dihydropteroate synthase  33.8 
 
 
408 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  32.04 
 
 
274 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  34.05 
 
 
397 aa  138  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  36.17 
 
 
290 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  35.14 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  35.46 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  35.46 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  32.11 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  31.77 
 
 
278 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
402 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  30.14 
 
 
376 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  32.04 
 
 
287 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  33.57 
 
 
394 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  33.8 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  34.71 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  34.74 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  30.18 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  32.85 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  33.45 
 
 
285 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  28.98 
 
 
275 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  33.22 
 
 
302 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  32.74 
 
 
413 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  32.85 
 
 
407 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  34.89 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  31.45 
 
 
289 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  30.58 
 
 
277 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0151  dihydropteroate synthase  32.98 
 
 
279 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1582  dihydropteroate synthase  32.98 
 
 
279 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0972411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5341  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
283 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  34.93 
 
 
294 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  33.7 
 
 
262 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1815  dihydropteroate synthase  34.25 
 
 
410 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0448294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  30.99 
 
 
393 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  30.69 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  31.29 
 
 
279 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  33.66 
 
 
300 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  33.1 
 
 
347 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  30.53 
 
 
286 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  30.38 
 
 
291 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1387  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
405 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  32.62 
 
 
279 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  30.32 
 
 
277 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1439  dihydropteroate synthase  31.65 
 
 
297 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  29.69 
 
 
303 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1505  dihydropteroate synthase  31.65 
 
 
289 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  30.69 
 
 
280 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  30.94 
 
 
279 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  30.32 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  30.32 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  30.32 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  30.69 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  30.32 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  30.32 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  32.61 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  31.08 
 
 
412 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  30.85 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  32.06 
 
 
285 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  29.96 
 
 
286 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  34.41 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1844  dihydropteroate synthase  34.09 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  29.76 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  28.99 
 
 
274 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  30.25 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  29.41 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  35.23 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  31.32 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  32.44 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  30.39 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
817 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  31.54 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0002  dihydropteroate synthase  34.45 
 
 
427 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0616652  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  31.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  30.32 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  30.07 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  31.82 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  31.82 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  34.27 
 
 
303 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  31.52 
 
 
289 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  33.45 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2130  dihydropteroate synthase  34.19 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.202113  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  30.07 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  37.41 
 
 
810 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  31.54 
 
 
282 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  31.34 
 
 
264 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 
283 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>