More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0366 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0366  ABC transporter related  100 
 
 		 327 aa  650    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  77.13 
 
 		 328 aa  528  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  76.22 
 
 		 334 aa  522  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  75.61 
 
 		 328 aa  513  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  50.85 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.05 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.8 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.17 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.12 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.06 
 
 		 371 aa  248  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.73 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  42.55 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  39.88 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  42.6 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  41.64 
 
 		 343 aa  245  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  46.72 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 351 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  39.6 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.98 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  37.82 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.14 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  46.71 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  39.08 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  45.32 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.71 
 
 		 372 aa  242  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  41.12 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.96 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  40 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.37 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  38.28 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.11 
 
 		 358 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  39.55 
 
 		 381 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  47.47 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  38.29 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.33 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  40.99 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  40 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  37.57 
 
 		 363 aa  238  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.59 
 
 		 372 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 353 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.43 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  37.39 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  38.48 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.69 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.89 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  42.86 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  42.86 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  41.67 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.33 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.33 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.33 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.02 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  42.96 
 
 		 350 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  42.36 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.94 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  40.87 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  44.13 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.02 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  47.15 
 
 		 399 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  37.92 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  39.65 
 
 		 346 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  39.65 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  47.37 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.18 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  47.37 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  44.88 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  43.92 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>