286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0202 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0202  ExsB family protein  100 
 
 
270 aa  558  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2106  ExsB family protein  80.45 
 
 
266 aa  449  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.060308  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1266  ExsB family protein  80 
 
 
275 aa  436  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.332484  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1856  ExsB family protein  80.23 
 
 
276 aa  436  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  35.77 
 
 
224 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  37.3 
 
 
219 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  32.13 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  33.2 
 
 
218 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  31.33 
 
 
224 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  30.9 
 
 
224 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  31.3 
 
 
222 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  31.37 
 
 
237 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  30.34 
 
 
224 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  32.79 
 
 
218 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  33.33 
 
 
221 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  32.78 
 
 
221 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  31.75 
 
 
224 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  36.44 
 
 
222 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  33.73 
 
 
225 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  32.52 
 
 
251 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  34.15 
 
 
228 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  31.49 
 
 
224 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  31.45 
 
 
230 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  34.15 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  29.2 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  29.18 
 
 
225 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  31.58 
 
 
233 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  31.09 
 
 
484 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  30.77 
 
 
222 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  31.89 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  29.84 
 
 
219 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  32.93 
 
 
226 aa  95.5  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  31.56 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  31.82 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  33.47 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  32.93 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  32.53 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  32.03 
 
 
224 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  30.61 
 
 
233 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  34.57 
 
 
236 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  33.07 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  32.26 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  32.53 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  32.79 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  30.56 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  30.28 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  31.75 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  32.79 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  30.2 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  31.2 
 
 
227 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  29.76 
 
 
225 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  30.4 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  32.93 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  32.68 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  28.46 
 
 
222 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  30.04 
 
 
232 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  29.37 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  31.85 
 
 
229 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  30.4 
 
 
230 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  31.85 
 
 
229 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  31.75 
 
 
231 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  30.98 
 
 
228 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  34 
 
 
257 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  32.42 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  30.45 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  32.39 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  30.71 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  30.71 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  31.23 
 
 
229 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  28.86 
 
 
229 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  30.68 
 
 
232 aa  85.9  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  31.08 
 
 
227 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  30.95 
 
 
226 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  31.5 
 
 
229 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  30.08 
 
 
235 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  33.2 
 
 
226 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  30.04 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  31.2 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  30.68 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  31.69 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  30.95 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  30.71 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  31.6 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  30.45 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  30.95 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  32.14 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  30.28 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  31.08 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  31.84 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  30.95 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  32.81 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  31.02 
 
 
220 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  32.93 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  28.63 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  31.6 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  29.84 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  32.79 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  30.77 
 
 
225 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  29.88 
 
 
224 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>