11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0092 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0092    100 
 
 
498 bp  987    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000709571 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  89.66 
 
 
546 bp  101  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  90.24 
 
 
555 bp  99.6  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  90.41 
 
 
540 bp  89.7  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  86.25 
 
 
552 bp  71.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  88.33 
 
 
546 bp  63.9  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  79.29 
 
 
543 bp  60  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  88.89 
 
 
573 bp  60  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  87.23 
 
 
495 bp  46.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  91.43 
 
 
474 bp  46.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  91.43 
 
 
630 bp  46.1  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>