32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0051 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0051  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.03 
 
 		 299 aa  427  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.17648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.79 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000135949 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0086  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.42 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.200683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1645  hypothetical protein  39.44 
 
 		 594 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.942552  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.36 
 
 		 628 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1082  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 606 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 623 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0045  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  31.94 
 
 		 589 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0266791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  33.77 
 
 		 635 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 612 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  33.33 
 
 		 600 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0807  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40 
 
 		 589 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  40.35 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 592 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 590 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  37.93 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3189  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38 
 
 		 610 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0148246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2698  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  33.8 
 
 		 587 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 593 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2277  thiamine pyrophosphate enzyme  40.85 
 
 		 631 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00118672  hitchhiker  0.00000449131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1952  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  40.38 
 
 		 806 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1133  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.21 
 
 		 601 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.028644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3088  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  47.83 
 
 		 579 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.144325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2135  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.66 
 
 		 583 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00067173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0935  thiamine pyrophosphate enzyme  43.55 
 
 		 592 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1856  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  37.18 
 
 		 591 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0012432  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.22 
 
 		 590 aa  42.7  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1740  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 578 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2559  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  37.93 
 
 		 832 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0484461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3081  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.64 
 
 		 832 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>