89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0002 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0001  cell division control protein 6  76.23 
 
 
389 aa  647    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0002  cell division control protein 6  100 
 
 
390 aa  796    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0659  cell division control protein 6  75.19 
 
 
389 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.733498  normal  0.0101732 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0005  cell division control protein 6  74.68 
 
 
389 aa  611  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0923  cell division control protein 6  41.62 
 
 
397 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1831  orc1/cdc6 family replication initiation protein  36.1 
 
 
413 aa  226  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0892755  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2046  cell division control protein 6  31.3 
 
 
417 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0265  cell division control protein 6  30.02 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.626816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0586  AAA ATPase  29.14 
 
 
396 aa  146  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1604  cell division control protein 6  31.66 
 
 
373 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00370034  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1452  cell division control protein 6  28.11 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0871  AAA ATPase  29.68 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1233  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.87 
 
 
397 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  26.1 
 
 
396 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1733  cell division control protein 6  26.67 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0976  cell division control protein 6  27.91 
 
 
414 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.39 
 
 
415 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.974406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  25.58 
 
 
425 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0001  AAA ATPase  26.91 
 
 
430 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2631  cell division control protein 6  29.77 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0815  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.57 
 
 
516 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00880215  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2471  AAA ATPase, central region  25.59 
 
 
424 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.14 
 
 
557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.810382 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0400  cell division control protein 6  28.53 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.481947  normal  0.0700474 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1613  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.52 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0001  AAA ATPase  25.8 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.801297  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1055  cell division control protein 6  28.21 
 
 
375 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2065  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.52 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0669  cell division control protein 6  27.25 
 
 
382 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145991  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3634  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.54 
 
 
376 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.27 
 
 
420 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00890369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1200  cell division control protein 6  25.58 
 
 
373 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1078  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.86 
 
 
398 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0679  cell division control protein 6  27.08 
 
 
374 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.894829 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.48 
 
 
375 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.384575  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0001  cell division control protein 6 family protein  22.57 
 
 
400 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2143  cell division control protein 6  25.57 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1930  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.37 
 
 
652 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0445  cell division control protein 6  26.79 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.37 
 
 
618 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2747  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.39 
 
 
442 aa  92.8  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2833  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.53 
 
 
410 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3641  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.82 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3512  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.4 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3760  ORC complex protein Cdc6/Orc1  22.92 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00211875  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2021  cell division control protein 6  29.13 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.377999  normal  0.256652 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3916  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.96 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5210  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.89 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0701  AAA ATPase  26.67 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00101638 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2958  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.27 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3320  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.18 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1814  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.87 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135499  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1843  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.89 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0706  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.86 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.93 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.226569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.57 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.07 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5244  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.34 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3217  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.16 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3963  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.32 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2434  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.43 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2694  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.84 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2559  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.81 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3611  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.08 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.014824  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1524  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.34 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0824685  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1085  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.46 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2323  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.25 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1155  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.14 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5222  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.8 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00704323  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  24.87 
 
 
784 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3152  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.7 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1077  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.68 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0510  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.6 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4912  Sigma 54 interacting domain protein  23.43 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2997  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.64 
 
 
499 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1683  cell division control protein 6 family protein  24.08 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1622  AAA ATPase  24.78 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0918  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.38 
 
 
459 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1887  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.24 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0446  AAA ATPase  24.92 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37384  predicted protein  22.39 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0256729  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3249  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5104  AAA ATPase  22.6 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3539  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.48 
 
 
487 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4773  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.73 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0368  orc1/cdc6 family replication initiation protein  20.33 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364207  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3367  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.99 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2050  membrane protein  28.24 
 
 
786 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.92 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>