86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3530 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3530  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  100 
 
 		 318 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1287  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  39.37 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0108847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3665  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.84 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000857364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2872  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.02 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4620  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.88 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0519  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.57 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0543  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.23 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2068  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  32.69 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.195031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.97 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0135  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.97 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2767  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.38 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.922315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3700  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  34.01 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0586  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.97 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0942826  normal  0.0399726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03723  putative conserved protein  32.8 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03672  hypothetical protein  32.8 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4213  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.8 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1242  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.502361  normal  0.183094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4804  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  37.25 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0138053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00123  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  32.97 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1987  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.02 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2598  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.46 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51340  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.48 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1176  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.68 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0543  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.23 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6031  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.89 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0444196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3414  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.6 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302272  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2177  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  32.45 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.38 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4125  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.02 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0845  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.67 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0937  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.95 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0962  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.95 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0392  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.62 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2012  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.6 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3489  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.06 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2605  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  32.69 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0042  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.8 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.351596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0743  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.99 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6942  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.98 
 
 		 380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967621  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3833  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  30 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3690  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.44 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3534  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  34.58 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3614  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.13 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0437  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.57 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1269  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.08 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.08 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0409  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.08 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3488  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.08 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0545  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.49 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3296  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.08 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.18 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4929  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3451  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.18 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0038  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.65 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0023  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.97 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0028  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.44 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0502  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.64 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1371  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.97 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3594  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.42 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.943632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0007  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  30.51 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0898  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.39 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0054  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.71 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1097  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4203  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03521  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.225897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03577  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  29.25 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4059  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2246  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  28.35 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279182  hitchhiker  0.00000435705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3906  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0949  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.38 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4221  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  27.3 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.25 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4114  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  27.3 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4163  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  27.3 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0939  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.28 
 
 		 309 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.340074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0881  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.28 
 
 		 309 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1422  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.1 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2748  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.43 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3914  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  30.51 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0112503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1015  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.49 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3954  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.68 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3778  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  24.51 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2759  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  25.19 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2588  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  27.61 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2998  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  27.61 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>