88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1773 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  68.91 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  61.92 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  60 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  58.65 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  58.78 
 
 		 257 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  58.4 
 
 		 257 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  59.84 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  59.84 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  58.94 
 
 		 257 aa  291  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  59.43 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  60.25 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  60.25 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  60.25 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  59.84 
 
 		 259 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  57.55 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  59.84 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  59.66 
 
 		 257 aa  286  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  58.61 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  56.43 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  54.39 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  53.97 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  54.39 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  54.73 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  54.73 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  54.73 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  52.72 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  51.87 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  51.68 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  53.88 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  53.75 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  52.94 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  50.81 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  54.91 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  49.79 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  46.72 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  46.22 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  44.07 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  45.34 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  44.07 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  41.91 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  41.91 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  38.52 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  43.22 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  40.97 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  43.57 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  43.64 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  43.88 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  43.88 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  37.66 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  36.9 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  37.8 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  35.98 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  31.56 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  43.92 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  33.63 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  29.38 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  27.36 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  31.44 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  27.35 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  29.44 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  23.74 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  24.69 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  23.83 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  24.75 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  25.33 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  25.77 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  22.4 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  24.61 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  24.04 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  22.97 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  26.74 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  23.61 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>