284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2106 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2106  ExsB family protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.060308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0202  ExsB family protein  80.45 
 
 		 270 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1856  ExsB family protein  79.85 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1266  ExsB family protein  79.39 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.332484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0040  ExsB family protein  34.96 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  34.43 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  32.14 
 
 		 224 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  32.77 
 
 		 484 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  32.92 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  31.37 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  29.67 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  33.61 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  30.65 
 
 		 221 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  34.4 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  32.52 
 
 		 226 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  31.28 
 
 		 218 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  29.13 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  28.74 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  31.87 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  29.15 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0438  exsB protein  33.06 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000182175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  32.24 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  27.46 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  31.02 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  30.86 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  30.33 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  31.56 
 
 		 217 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  28.33 
 
 		 224 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  31.3 
 
 		 226 aa  92  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  27.9 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  31.2 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  28.33 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  30.71 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  30.43 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  29.53 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  30.61 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  31.23 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  29.92 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  28.74 
 
 		 233 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  31.02 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  32.52 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  32.52 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  30 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  31.47 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  30.04 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  31.25 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  29.39 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  29.53 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  29.53 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  27.78 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  29.84 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  30.52 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  29.32 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  30.12 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  29.76 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  32.03 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  30.98 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  29.63 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  28.57 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  31.23 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  29.02 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  28.74 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  28.74 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  30.58 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  31.03 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  30.49 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  33.6 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  28.74 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  32.41 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  29.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  27.08 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  28.46 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  29.88 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  27.08 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  29.03 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  29.22 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  29.48 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  29.53 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  30.33 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  29.44 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  30 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  27.67 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  30.16 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  31.03 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  29.2 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  28.63 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  29.32 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  29.32 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  32.53 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  29.79 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  27.98 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  28.74 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  29.08 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  29.32 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  29.96 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  29.72 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  29.96 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  28.23 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  29.03 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>