71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0709 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0709  thymidylate synthase, flavin-dependent  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.62086  normal  0.337229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0501  thymidylate synthase, flavin-dependent  82.04 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0769  thymidylate synthase, flavin-dependent  82.04 
 
 		 244 aa  425  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.354412  normal  0.842984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1753  thymidylate synthase, flavin-dependent  81.22 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  48.94 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  41.95 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  41.18 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.33 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  36.04 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  32.75 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  36.52 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.77 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  38.95 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.79 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  39.19 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  36.87 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  36.26 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.22 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  39.13 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.66 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  35.09 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  38.06 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  38.06 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  31.19 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  31.19 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  35.91 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.29 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  33.84 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.9 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  29.09 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  30.81 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.49 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  30.96 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.71 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  34.36 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.68 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.91 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  34.39 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  29.91 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.54 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.91 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.56 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  33.74 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  33.74 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  32.72 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.32 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0584  thymidylate synthase complementing protein ThyX  35.03 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000716478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  31.52 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.21 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.41 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.46 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.13 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.51 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  30.2 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  29.7 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  29.01 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.89 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  28.4 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  25.57 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  29.01 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  25.57 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  26.74 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  29.89 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  27.51 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  27.04 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  30.43 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  29.41 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>