252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0610 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0610  purine phosphorylases family protein 1  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.807102  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  74.66 
 
 
222 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  71.95 
 
 
222 aa  322  4e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0814  purine phosphorylase family protein 1  72.81 
 
 
221 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  42.79 
 
 
236 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  44.12 
 
 
238 aa  158  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  42.65 
 
 
238 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  43.2 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  45.59 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  41.94 
 
 
242 aa  142  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  41.94 
 
 
236 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  36.89 
 
 
241 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  35.86 
 
 
262 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  34.48 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  34.06 
 
 
241 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  36.06 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  35.64 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  34.47 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  34.78 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  35.47 
 
 
243 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  38.42 
 
 
247 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  38.42 
 
 
247 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  34.48 
 
 
242 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  32.7 
 
 
263 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  32.88 
 
 
244 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  35.58 
 
 
250 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  35.85 
 
 
271 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  35.15 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  33.65 
 
 
238 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  32.57 
 
 
244 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  32.57 
 
 
244 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  31.33 
 
 
233 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  34.65 
 
 
252 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  31.63 
 
 
243 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  32.29 
 
 
275 aa  99.4  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  33.19 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  32.08 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  32.08 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  34.43 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  34.43 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  32.67 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  32.67 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  32.18 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  32.87 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  32.87 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  33.17 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  33.49 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  36.57 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  33.49 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  33.49 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  34.8 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  32.17 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  32.17 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  32.41 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  32.18 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  35.62 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  32.18 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  33.82 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  36.46 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  33.96 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  35.05 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  33.82 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1668  purine or other phosphorylase family 1  37.38 
 
 
253 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.279636  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  34.42 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  34.43 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  34.58 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0828  purine nucleoside phosphorylase  34.65 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  34.65 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  34.65 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  34.06 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  32.64 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  32.75 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  33.96 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  32.31 
 
 
236 aa  92  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>