33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0086 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0086  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.8 
 
 		 298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000135949 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.45 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.17648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0051  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.42 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.200683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1645  hypothetical protein  39.56 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.942552  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 612 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  31.87 
 
 		 612 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.21 
 
 		 628 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  38.81 
 
 		 635 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  41.51 
 
 		 600 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 590 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.41 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 623 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0863  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.21 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0171  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  48.08 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2358  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  40.28 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1740  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0613  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.29 
 
 		 601 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0102763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0935  thiamine pyrophosphate enzyme  44.44 
 
 		 592 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  40 
 
 		 791 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2033  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  38.95 
 
 		 584 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000299655 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0807  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  34.94 
 
 		 589 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3189  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40 
 
 		 610 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0148246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  31.25 
 
 		 1160 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0045  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  35.19 
 
 		 589 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0266791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3088  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  45.65 
 
 		 579 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.144325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2194  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  38.95 
 
 		 584 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00113388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 624 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 		 626 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 		 626 aa  42.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>