61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1722 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  349  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000228174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.05 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  37.14 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.85 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.68 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.48 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.3 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.74 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.32 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  29.82 
 
 		 327 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  33.66 
 
 		 315 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.67 
 
 		 342 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.3 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.31 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  31.82 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.48 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  31.31 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.3 
 
 		 330 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.77 
 
 		 355 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.69 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.7 
 
 		 342 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  32.67 
 
 		 328 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.97 
 
 		 338 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.77 
 
 		 333 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.69 
 
 		 328 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.39 
 
 		 330 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.81 
 
 		 346 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.78 
 
 		 345 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.1 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 339 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.97 
 
 		 337 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.39 
 
 		 330 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.81 
 
 		 350 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.77 
 
 		 347 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  32.32 
 
 		 329 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.77 
 
 		 350 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.77 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.41 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.41 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.32 
 
 		 326 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.31 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.31 
 
 		 330 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.47 
 
 		 266 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.9 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.3 
 
 		 298 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.29 
 
 		 329 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.29 
 
 		 334 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.29 
 
 		 333 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.81 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.88 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.13 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.38 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.38 
 
 		 341 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.04 
 
 		 327 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.42 
 
 		 293 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  28.57 
 
 		 273 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.68 
 
 		 339 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.57 
 
 		 231 aa  44.3  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.42 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>