87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0917 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0917  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  100 
 
 
519 aa  1031    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1266  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  79.46 
 
 
516 aa  820    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1201  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  83.72 
 
 
516 aa  872    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0809  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  80.81 
 
 
516 aa  848    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.61044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0064  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.5 
 
 
458 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000825924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03490  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  71.27 
 
 
376 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002526  oxaloacetate decarboxylase beta chain  71 
 
 
376 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0640  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  71.08 
 
 
376 aa  511  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0086  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  71 
 
 
376 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.923092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3375  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  73.52 
 
 
376 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3011  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  70.08 
 
 
376 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0605  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  67 
 
 
436 aa  514  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1050  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  69.27 
 
 
377 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2892  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  66.58 
 
 
378 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0351319  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1258  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase biotin carboxyl carrier subunit alpha  61.59 
 
 
443 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.913134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02840  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  70.31 
 
 
376 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3622  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  69.85 
 
 
390 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000349445  hitchhiker  0.000000446411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3197  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  70.08 
 
 
379 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107579  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1031  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  73.46 
 
 
376 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  73.39 
 
 
376 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1741  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  68.72 
 
 
376 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1093  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.91 
 
 
376 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1127  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.91 
 
 
376 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2985  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.63 
 
 
376 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.733812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.35 
 
 
376 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1221  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  73.18 
 
 
377 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1026  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.91 
 
 
376 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3265  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.83 
 
 
376 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1053  oxaloacetate decarboxylase  69.65 
 
 
376 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3164  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  72.35 
 
 
376 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1200  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.99 
 
 
376 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1322  glutaconyl-CoA decarboxylase  71.99 
 
 
376 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0119077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3335  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.15 
 
 
376 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2479  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  70.16 
 
 
375 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1492  glutaconyl-CoA decarboxylase beta subunit  61.58 
 
 
370 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0159163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1307  oxaloacetate decarboxylase  62.08 
 
 
420 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0998305  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1850  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  61 
 
 
371 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0694  oxaloacetate decarboxylase  70.79 
 
 
440 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00230113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0319  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  57.77 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0972  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  71.06 
 
 
444 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.35 
 
 
433 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.132607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0061  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.76 
 
 
433 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3649  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  72.12 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3711  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.12 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0895  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  58.88 
 
 
433 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0058  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  58.88 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.76 
 
 
433 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.566525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0060  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.44 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3543  oxaloacetate decarboxylase beta chain  59.11 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3542  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.44 
 
 
433 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.069232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0203  oxaloacetate decarboxylase beta subunit  59.09 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0804  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.44 
 
 
433 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0863  oxaloacetate decarboxylase beta chain  71.79 
 
 
433 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3614  oxaloacetate decarboxylase beta chain  72.44 
 
 
433 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0832  oxaloacetate decarboxylase beta chain  71.79 
 
 
433 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2434  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.47 
 
 
360 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13524  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1366  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.52 
 
 
371 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0970763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0886  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.79 
 
 
378 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1275  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.37 
 
 
376 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0294  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.18 
 
 
374 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1434  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  54.89 
 
 
378 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0944  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.25 
 
 
374 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3692  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  55.03 
 
 
376 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2282  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.76 
 
 
376 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0953  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  54.47 
 
 
376 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.126318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1925  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.47 
 
 
380 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0509  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.22 
 
 
359 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1666  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.21 
 
 
378 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3314  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.65 
 
 
416 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0996  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.57 
 
 
388 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3585  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.53 
 
 
379 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.330233  normal  0.310791 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1898  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.23 
 
 
378 aa  359  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1608  methylmalonyl-CoA decarboxylase, beta subunit  55.25 
 
 
383 aa  358  9.999999999999999e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1820  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.94 
 
 
376 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3673  glutaconyl-CoA decarboxylase  52.1 
 
 
376 aa  352  8e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.523011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0382  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.54 
 
 
385 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.159911  normal  0.654104 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.56 
 
 
374 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1310  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.81 
 
 
383 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.84 
 
 
374 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0241  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.28 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.140679  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0204  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.12 
 
 
554 aa  336  5e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.928975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1756  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  37.85 
 
 
375 aa  253  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1055  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.83 
 
 
404 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3300  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.35 
 
 
404 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1320  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.39 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3311  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  33.76 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2305  pyruvate carboxyltransferase  70.13 
 
 
216 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>