More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03704 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03704  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  92.63 
 
 		 95 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1622  co-chaperonin GroES  87.37 
 
 		 95 aa  169  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1692  co-chaperonin GroES  86.32 
 
 		 95 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0464851  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  63.16 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  59.57 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  54.26 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  54.26 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  54.26 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  52.13 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0345  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  50 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  53.85 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  52.63 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>