49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03461 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03461  transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  42.07 
 
 		 1075 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  40.41 
 
 		 1089 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  40.41 
 
 		 1067 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  40.41 
 
 		 1092 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  40.41 
 
 		 1089 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40.69 
 
 		 1075 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  41.5 
 
 		 1124 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40.69 
 
 		 1063 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 1080 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  39.73 
 
 		 1075 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 		 1102 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  42.36 
 
 		 1074 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  36.91 
 
 		 1131 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 1092 aa  79.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.43 
 
 		 1823 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.23 
 
 		 1623 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 973 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 1078 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.03 
 
 		 1344 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  31.15 
 
 		 1733 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  35.76 
 
 		 1301 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  34.69 
 
 		 1401 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.43 
 
 		 1153 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.33 
 
 		 1357 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 972 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 969 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 969 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1265 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 965 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 897 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1657 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.36 
 
 		 1699 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 		 947 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.78 
 
 		 1194 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 885 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1399 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 902 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.62 
 
 		 1686 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 		 1760 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.85 
 
 		 1481 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1230 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.43 
 
 		 1267 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.71 
 
 		 1510 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1152 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 		 1256 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 		 1334 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1157 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.41 
 
 		 1599 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>