More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00189 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00189  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 573 aa  1130    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.226248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.46 
 
 		 595 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  25.74 
 
 		 599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  29.27 
 
 		 618 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  25.61 
 
 		 564 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  25.42 
 
 		 594 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  28.6 
 
 		 616 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  24.9 
 
 		 597 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  31.87 
 
 		 603 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  28.1 
 
 		 654 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  25.31 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  24.77 
 
 		 592 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.4 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.4 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  27.12 
 
 		 598 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  32.75 
 
 		 592 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  24.17 
 
 		 609 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  27.84 
 
 		 626 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  23.31 
 
 		 606 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  30.69 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.02 
 
 		 590 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  32.65 
 
 		 589 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.45 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  25.48 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  28.6 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  24.91 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  26.58 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.67 
 
 		 622 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  27.38 
 
 		 641 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  29.61 
 
 		 535 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.06 
 
 		 671 aa  100  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  27.1 
 
 		 622 aa  100  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  25.43 
 
 		 632 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  25.9 
 
 		 628 aa  100  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  27.79 
 
 		 627 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  27.79 
 
 		 627 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.1 
 
 		 603 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  35.83 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0902  hypothetical protein  26.86 
 
 		 562 aa  99  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  25.23 
 
 		 598 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0415  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  29.2 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.762356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2711  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  37.63 
 
 		 581 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0138021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.87 
 
 		 592 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  31.28 
 
 		 585 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1936  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.62 
 
 		 585 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.32 
 
 		 583 aa  98.2  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0598  ABC transporter related  36.73 
 
 		 600 aa  98.2  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.157755  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  21.38 
 
 		 578 aa  98.2  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  27.14 
 
 		 724 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  27.02 
 
 		 722 aa  97.4  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.11 
 
 		 613 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  32.49 
 
 		 726 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  34.87 
 
 		 596 aa  97.4  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  35.14 
 
 		 639 aa  97.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  32.49 
 
 		 726 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  32.67 
 
 		 658 aa  97.1  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 588 aa  97.1  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.49 
 
 		 726 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  26.18 
 
 		 600 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2049  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.97 
 
 		 585 aa  96.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  31.98 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0908  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.9 
 
 		 644 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  25.4 
 
 		 585 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  35.29 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  33.89 
 
 		 581 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  30.04 
 
 		 627 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3463  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.9 
 
 		 650 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  25.4 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  24.02 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  27.72 
 
 		 665 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.24 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  25.44 
 
 		 606 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  31.75 
 
 		 631 aa  95.9  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  22.52 
 
 		 585 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13640  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  27.13 
 
 		 574 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  32.34 
 
 		 586 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  27 
 
 		 627 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3849  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.45 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1578  ABC transporter related  26.15 
 
 		 561 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00291394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  34.2 
 
 		 590 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  34.2 
 
 		 590 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0873  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.33 
 
 		 644 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.44 
 
 		 575 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2702  ABC transporter related protein  32.95 
 
 		 588 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000694566  normal  0.246929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2952  ABC transporter related  23.89 
 
 		 584 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  24.3 
 
 		 575 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.44 
 
 		 575 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.44 
 
 		 575 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  25.34 
 
 		 610 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.44 
 
 		 574 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  34.2 
 
 		 590 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  28.74 
 
 		 652 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  24.33 
 
 		 603 aa  94.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1466  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.68 
 
 		 539 aa  94.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.44 
 
 		 596 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.44 
 
 		 596 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.44 
 
 		 574 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  22.67 
 
 		 586 aa  94.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  34.07 
 
 		 591 aa  94  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0899  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.33 
 
 		 642 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>