192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00023 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00023  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 130 aa  258  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0156654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  50.91 
 
 		 728 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  36.97 
 
 		 716 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  41.75 
 
 		 724 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 707 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  40.96 
 
 		 723 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 		 843 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 		 706 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 		 733 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 837 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 789 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  38.67 
 
 		 788 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 735 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 679 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 864 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 742 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 825 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  36.62 
 
 		 725 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 921 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 921 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 882 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 881 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.77 
 
 		 808 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 707 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 729 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 821 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 825 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 708 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 860 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 809 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 		 776 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 714 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.23 
 
 		 729 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.33 
 
 		 747 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.33 
 
 		 747 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 745 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  33.33 
 
 		 747 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 747 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 821 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 753 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  33.33 
 
 		 747 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 805 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 727 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  28.93 
 
 		 753 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 724 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 		 701 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 724 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  36 
 
 		 695 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 724 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 755 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 750 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 724 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.51 
 
 		 724 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  29.73 
 
 		 699 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 705 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  32.67 
 
 		 729 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 719 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 771 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  31.78 
 
 		 807 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  40.32 
 
 		 733 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  40.32 
 
 		 733 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0873  outer membrane receptor for Fe  31.94 
 
 		 712 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.474088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 714 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.89 
 
 		 729 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 729 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 712 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 806 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 709 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2000  outer membrane receptor for Fe  37.88 
 
 		 706 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 		 713 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 		 738 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 733 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 726 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 726 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 792 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 706 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  31.68 
 
 		 729 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 707 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 743 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 718 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 790 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  40.85 
 
 		 737 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 821 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 582 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 745 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 706 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 706 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1243 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 796 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 823 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 710 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 733 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>