More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3959 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  86.08 
 
 		 352 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3959  quinolinate synthetase complex, subunit A  100 
 
 		 352 aa  733    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1542  quinolinate synthetase  96.88 
 
 		 352 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  85.8 
 
 		 352 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4397  quinolinate synthetase  87.5 
 
 		 352 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  86.08 
 
 		 352 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35390  quinolinate synthetase  85.23 
 
 		 352 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  86.08 
 
 		 352 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  86.08 
 
 		 352 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  86.36 
 
 		 352 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  87.78 
 
 		 352 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000717846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  72.8 
 
 		 353 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3082  quinolinate synthetase  69.73 
 
 		 353 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0534607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2865  quinolinate synthetase  69.44 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000166963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1254  quinolinate synthetase  69.14 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00563741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1403  quinolinate synthetase  69.44 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2953  quinolinate synthetase  69.14 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000127352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1282  quinolinate synthetase  68.56 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000716329  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  66.86 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  65.98 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  66.86 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  66.86 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2232  quinolinate synthetase  66.86 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  66.37 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2202  quinolinate synthetase  66.57 
 
 		 360 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931792  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  66.27 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  66.86 
 
 		 355 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  65.98 
 
 		 360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2524  quinolinate synthetase  65.5 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.792691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  66.96 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  65.98 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  0.0000127586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  65.98 
 
 		 357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2128  quinolinate synthetase  65.68 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252809  hitchhiker  0.00117458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2326  quinolinate synthetase  66.57 
 
 		 355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00703  quinolinate synthetase  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2892  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0804  quinolinate synthetase  67.77 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0777  quinolinate synthetase  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0852  quinolinate synthetase  67.77 
 
 		 344 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000151704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0820  quinolinate synthetase  66.57 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0928901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  66.96 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0773  quinolinate synthetase  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000227851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0883  quinolinate synthetase  66.57 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00857048  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  65.38 
 
 		 355 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0852  quinolinate synthetase  72.94 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00075405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  65.58 
 
 		 353 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2898  quinolinate synthetase complex, A subunit  66.97 
 
 		 349 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000238804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  65.68 
 
 		 355 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00692  hypothetical protein  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2912  quinolinate synthetase  67.47 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00694281  normal  0.200335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  63.91 
 
 		 355 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0915  quinolinate synthetase  66.06 
 
 		 367 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0741807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0792  quinolinate synthetase  65.76 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000157841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1161  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.38 
 
 		 347 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  65.09 
 
 		 355 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  65.58 
 
 		 353 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1241  quinolinate synthetase  67.47 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000887562  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0671  quinolinate synthetase  67.17 
 
 		 347 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0851  quinolinate synthetase  65.96 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000370628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01614  quinolinate synthetase  64.99 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  64.58 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3071  quinolinate synthetase  67.31 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  66.57 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2236  quinolinate synthetase  66.07 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.694626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1131  quinolinate synthetase  66.06 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1026  quinolinate synthetase  66.07 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0959109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0974  quinolinate synthetase  65.77 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2105  quinolinate synthetase  66.07 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2651  quinolinate synthetase  66.07 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1895  quinolinate synthetase  65.06 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0978  quinolinate synthetase  65.77 
 
 		 378 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2820  quinolinate synthetase  62.65 
 
 		 374 aa  447  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  65.36 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  63.96 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2506  quinolinate synthetase  65.06 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  64.74 
 
 		 382 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  65.36 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2737  quinolinate synthetase  63.74 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.919283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5838  quinolinate synthetase  64.76 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2531  quinolinate synthetase  64.76 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.647299 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0102  quinolinate synthetase  63.25 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.535189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  62.13 
 
 		 395 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  62.35 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0776  quinolinate synthetase  64.56 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  63.16 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  62.94 
 
 		 377 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  62.87 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  64.2 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0789  quinolinate synthetase  64.16 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  normal  0.0932442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  63.36 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3153  quinolinate synthetase  64.26 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  0.197173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3850  quinolinate synthetase  62.35 
 
 		 375 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  64.07 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0702  quinolinate synthetase  64.84 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000554253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0813  quinolinate synthetase  63.36 
 
 		 379 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1476  quinolinate synthetase  64.52 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.646287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  62.54 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0938  quinolinate synthetase  61.9 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  64.44 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  60.24 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>