140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2826 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2826  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000275163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  88.54 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  74.49 
 
 		 215 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  70.83 
 
 		 224 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  70.83 
 
 		 224 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  70.83 
 
 		 224 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  59.38 
 
 		 213 aa  120  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  59.79 
 
 		 216 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  56.7 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  60.42 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  61.86 
 
 		 213 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.61 
 
 		 212 aa  110  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  55.21 
 
 		 589 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  57.14 
 
 		 216 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  60.82 
 
 		 201 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  54.17 
 
 		 598 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  60.82 
 
 		 213 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  53.06 
 
 		 612 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  61.22 
 
 		 588 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  58.76 
 
 		 219 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  59.38 
 
 		 554 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  58.76 
 
 		 219 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  58.76 
 
 		 219 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  58.76 
 
 		 219 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  58.76 
 
 		 219 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.86 
 
 		 213 aa  84.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.73 
 
 		 209 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.86 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.48 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  45.74 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  44.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  44.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  37.93 
 
 		 583 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.35 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.38 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.86 
 
 		 212 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  36.78 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.96 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40 
 
 		 211 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.58 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  36.47 
 
 		 583 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  36.47 
 
 		 583 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2483  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.78 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.86 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  37.35 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  38.64 
 
 		 566 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.68 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.04 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.41 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 		 581 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.99 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.86 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  35.71 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  35.71 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.26 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  35.63 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  39.77 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.58 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  35.63 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  38.2 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.55 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  41.11 
 
 		 567 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  42.53 
 
 		 572 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  38.75 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2359  DAK2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.21 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  40 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.29 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1228  Dak phosphatase  43.75 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0165141  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.56 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  36.9 
 
 		 616 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.32 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  38.2 
 
 		 544 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.04 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.55 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2458  Dak phosphatase  36.47 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.85851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.96 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.37 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0873  dihydroxyacetone kinase, C-terminal region  41.07 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0335187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0295747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>