43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0281 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  88.43 
 
 		 121 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  71.07 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  62.3 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2443  hypothetical protein  62.18 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0503835  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0017  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  60.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499101  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0009  hypothetical protein  60.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000754026  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0011  hypothetical protein  60.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0009  hypothetical protein  60.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  59.52 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2345  hypothetical protein  60.5 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  57.72 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  59.66 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5037  hypothetical protein  55.37 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.038586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  58.33 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  55.46 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  56.56 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  55 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  55 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  55.74 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  57.98 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  54.17 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  55 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  54.17 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  57.85 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  50.41 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  49.59 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2960  hypothetical protein  59.5 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  49.58 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  48.33 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  48.76 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  48.76 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  48.33 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  47.11 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  47.5 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  47.93 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  46.67 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  46.67 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  47.5 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  44.72 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2608  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  40.83 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000264068  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4162  hypothetical protein  49.15 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4154  hypothetical protein  36.67 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>