More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4571 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4571  cysteine synthase A  100 
 
 		 324 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1318  cysteine synthase A  99.38 
 
 		 324 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4092  cysteine synthase A  97.84 
 
 		 324 aa  613  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3871  cysteine synthase A  96.3 
 
 		 324 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.674292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1413  cysteine synthase  90.12 
 
 		 324 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3902  cysteine synthase A  87.65 
 
 		 324 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1583  cysteine synthase K/M:cysteine synthase A  87.96 
 
 		 324 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.615929  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  85.49 
 
 		 323 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29110  cysteine synthase A  85.8 
 
 		 324 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3986  cysteine synthase A  84.88 
 
 		 335 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32850  Cysteine synthase K/M:Cysteine synthase K  83.38 
 
 		 325 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3690  cysteine synthase A  75.31 
 
 		 323 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  70.37 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0489  cysteine synthase A  70.68 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04051  O-acetylserine (thiol)-lyase A  73.19 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1996  cysteine synthase  73.5 
 
 		 328 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.13993  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  71.3 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  69.62 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  69.3 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21201  O-acetylserine (thiol)-lyase A  72.61 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.872322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  69.85 
 
 		 323 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0776  cysteine synthase A  70.99 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000080483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  70.48 
 
 		 317 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02314  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000113698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1247  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000402338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3268  cysteine synthase A  70.68 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2569  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00204709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2251  cysteine synthase A  69.02 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.047552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1013  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 322 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0386297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2766  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2549  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000853816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02275  hypothetical protein  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000422758  decreased coverage  0.000025009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3645  cysteine synthase A  69.54 
 
 		 323 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00108358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2689  cysteine synthase A  68 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3447  cysteine synthase A  70.37 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0942235  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0664  cysteine synthase K/M/A  71.29 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2574  cysteine synthase A  68 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000179096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2623  cysteine synthase A  68 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1467  cysteine synthase  67.49 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2665  cysteine synthase A  68 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3190  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 322 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000841845  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04571  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.85 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.754639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04681  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.85 
 
 		 328 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04261  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.53 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1429  cysteine synthase A  70.37 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000782911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2520  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2942  cysteine synthase A  68 
 
 		 323 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000452572  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2468  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0868534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2795  cysteine synthase A  67.69 
 
 		 323 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1318  cysteine synthase A  70.37 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000253577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01309  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  68.52 
 
 		 322 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1699  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.678055  hitchhiker  0.0000451627 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0402  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.22 
 
 		 328 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2685  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0206306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2764  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776991  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2520  cysteine synthase A  69.25 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1741  O-acetylserine (thiol)-lyase A  69.4 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04581  O-acetylserine (thiol)-lyase A  69.4 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2663  cysteine synthase A  68.52 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1500  cysteine synthase  68.52 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1567  cysteine synthase  68.21 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1561  cysteine synthase  68.52 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2370  cysteine synthase A  67.9 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02168  cysteine synthase A  68.54 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2664  cysteine synthase  70.94 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.211268  normal  0.363932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2857  cysteine synthase A  69.44 
 
 		 322 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493872  hitchhiker  0.000671545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3639  cysteine synthase A  72.45 
 
 		 325 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0668301  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2382  cysteine synthase A  68.83 
 
 		 322 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  67.19 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  66.77 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1721  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2438  cysteine synthase A  70.35 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1682  cysteine synthase A  69.75 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0068  cysteine synthase A  66.25 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1508  cysteine synthase A  69.75 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1983  cysteine synthase A  68.99 
 
 		 317 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000049928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0552  cysteine synthase A  69.78 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  64.98 
 
 		 324 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2517  cysteine synthase A  67.39 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  64.97 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2072  cysteine synthase A  66.77 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0562  cysteine synthase A  69.81 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2138  cysteine synthase  68.75 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166923  decreased coverage  0.0000932984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  58.41 
 
 		 308 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  55.49 
 
 		 316 aa  319  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.39 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.29 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.65 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.55 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53.46 
 
 		 311 aa  315  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  56.37 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  52.72 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.03 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  52.08 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  58.73 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  52.98 
 
 		 304 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.97 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>