14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4069 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  91.67 
 
 		 104 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  94.95 
 
 		 99 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  87.76 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  41.51 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  36.47 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  32.88 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  36.23 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  34.67 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>