54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2583 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2583  acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3133  GCN5-related N-acetyltransferase  98.77 
 
 
163 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723926  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  89.57 
 
 
163 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.421071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  82.21 
 
 
163 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  0.0709492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4331  GCN5-related N-acetyltransferase  66.24 
 
 
162 aa  217  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4035  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
160 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.631487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
166 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
166 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0148  acetyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.517049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2353  acetyltransferase  28.57 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18870  predicted protein  23.87 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.884132  hitchhiker  0.00000118094 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1614  acetyltransferase  24.05 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  24.11 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05866  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_2G11500)  24.58 
 
 
288 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0421279  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62543  aries arylalkylamine N-acetyltransferase  29.31 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.854998 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0406  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.49 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  22.88 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
364 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
327 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_7294  predicted protein  23.64 
 
 
160 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00181231  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_7293  predicted protein  24.24 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1114  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.71 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
269 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  31.4 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.66 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4380  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
167 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  26.74 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03206  hypothetical protein  34.92 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.5 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4800  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0178768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0261476  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  21.76 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24990  acetyltransferase  29.7 
 
 
367 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  30.23 
 
 
175 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  29.46 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
183 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  25.43 
 
 
295 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20444  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
168 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1088  citrate lyase ligase  28.21 
 
 
338 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
131 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
131 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.457059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1009  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
131 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2108  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  27.35 
 
 
528 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>