117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1020 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1020  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1058  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.590363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1018  aldose 1-epimerase  97.89 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4204  aldose 1-epimerase  97.54 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1298  hypothetical protein  72.14 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4365  aldose 1-epimerase  71.79 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0939645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1118  aldose 1-epimerase  70.36 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1155  aldose 1-epimerase  55.04 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282686  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23050  hypothetical protein  48.58 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1945  hypothetical protein  48.58 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1587  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000393399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1856  Aldose 1-epimerase  31.15 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0227649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  32.32 
 
 		 925 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6210  hypothetical protein  33.96 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71570  hypothetical protein  32.84 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  33.1 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1394  aldose 1-epimerase  29.26 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48620  Aldose 1-epimerase family protein  33.09 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.462655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1989  aldose 1-epimerase  32.13 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000239018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2352  hypothetical protein  32.13 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000296261  normal  0.0460895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2097  aldose 1-epimerase  32.13 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000289765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0341  aldose 1-epimerase  30 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  31.09 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1826  aldose 1-epimerase  33.84 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.51985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5240  aldose 1-epimerase  31.02 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  32.39 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  32.04 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  32.04 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  30.82 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2504  aldose 1-epimerase family protein  32.75 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000981757  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  30.82 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  32.05 
 
 		 720 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  32.39 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  29.62 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5381  aldose 1-epimerase  31.39 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934707  normal  0.209999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5332  aldose 1-epimerase  30.29 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0088  aldose 1-epimerase  30.32 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  33.47 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  29.55 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0142  aldose 1-epimerase  30.18 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5490  aldose 1-epimerase family protein  30.88 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5044  aldose 1-epimerase  30.88 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3996  Aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.342711  normal  0.114283 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  30.42 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5618  aldose 1-epimerase  27.05 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635516  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  31.3 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  32.13 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002907  UPF0010 protein yeaD  30 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0184423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2139  Aldose 1-epimerase  26.14 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.931505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2729  aldose 1-epimerase  29.77 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36372  hitchhiker  0.00135613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1848  putative aldose 1-epimerase  28.35 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.905542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1615  aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2697  aldose 1-epimerase  29.92 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.459697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0617  aldose 1-epimerase  29.56 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000473738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0934  aldose 1-epimerase  31.14 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1915  aldose 1-epimerase  28.41 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.218875  normal  0.439365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1674  aldose 1-epimerase  30.11 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.174829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  29.89 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1261  Aldose 1-epimerase  30.42 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2769  hypothetical protein  29.17 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1851  aldose 1-epimerase  28.08 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1725  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2165  aldose 1-epimerase  29.32 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2460  aldose 1-epimerase  28.41 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2553  aldose 1-epimerase  28.41 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0396269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2388  aldose 1-epimerase  28.41 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2135  aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000747241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2567  Aldose 1-epimerase  28.14 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0100101  hitchhiker  0.000801765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1722  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000918038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2307  aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2115  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22010  aldose 1-epimerase-like enzyme  29.43 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.877167  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2109  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1588  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0287  aldose 1-epimerase  26.77 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14410  aldose 1-epimerase-like enzyme  28.57 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0126  Aldose 1-epimerase  28.17 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1765  aldose 1-epimerase  27.76 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186472  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23210  aldose 1-epimerase-like enzyme  29.05 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2611  aldose 1-epimerase  25.33 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.100158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1633  aldose 1-epimerase  26.29 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1468  transglycolase; epimerase  26.53 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01249  uncharacterized aldose 1-epimerase-like protein  25 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2733  aldose 1-epimerase  30.33 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.616833  normal  0.530659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1264  aldose 1-epimerase-like protein  27.57 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1046  aldose 1-epimerase  28.75 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2040  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.439926  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34850  predicted protein  27.15 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00760317  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39789  predicted protein  26.56 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>