136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0285 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  93.33 
 
 
90 aa  182  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  90 
 
 
90 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  88.64 
 
 
90 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  88.64 
 
 
90 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  78.65 
 
 
90 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  78.65 
 
 
90 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  78.89 
 
 
90 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  78.89 
 
 
90 aa  157  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  67.05 
 
 
90 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3177  hypothetical protein  63.64 
 
 
90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.293941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0759  hypothetical protein  52.27 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  55.06 
 
 
90 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  55.68 
 
 
93 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0523  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000507577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  52.22 
 
 
92 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  52.22 
 
 
91 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  50.56 
 
 
93 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  50.56 
 
 
93 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  53.33 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  52.27 
 
 
90 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  52.87 
 
 
92 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  49.44 
 
 
90 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  49.44 
 
 
90 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  51.14 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  51.14 
 
 
91 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0094  hypothetical protein  48.81 
 
 
96 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  51.14 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  52.75 
 
 
90 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  48.86 
 
 
91 aa  96.7  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  55.68 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0087  hypothetical protein  47.62 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  47.73 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0375  hypothetical protein  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.374308  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  52.27 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  51.69 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  48.89 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  52.87 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  51.14 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  47.73 
 
 
91 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  52.27 
 
 
91 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  47.73 
 
 
91 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  47.78 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  47.78 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  47.78 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  47.78 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  49.41 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  47.78 
 
 
91 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  49.41 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  47.78 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3408  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.070297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0881  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3207  Fe(II) trafficking protein YggX  48.86 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1318  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.959327  normal  0.498401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  48.86 
 
 
91 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02792  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3395  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4266  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>