12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0080 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0095  hypothetical protein  95.12 
 
 		 205 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0095  hypothetical protein  78.05 
 
 		 184 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000456218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0098  hypothetical protein  75.61 
 
 		 182 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0028  hypothetical protein  49.77 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36450  hypothetical protein  33.82 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00361093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3127  hypothetical protein  34.13 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  30.26 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  24.22 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>