84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0016 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_tRNAAspVIMSS1309155  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0722845  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAspVIMSS1309079  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAspVIMSS1309111  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAspVIMSS1309200  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0997712 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101235  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0025  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAspVIMSS1309352  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0875089  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAspVIMSS1309266  tRNA-Asp  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0027  tRNA-Asp  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0040  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0059  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000338363  unclonable  0.0000000922471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0009  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0008  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.856422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0025  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.086727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0048  tRNA-Asp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0789708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0020  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00624346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0002  tRNA-Asp  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.862537  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.23 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.389049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1482 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1479 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1479 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  86.79 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  86.79 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0006  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000433123  normal  0.0757617 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1589  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.153421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37120  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176209  normal  0.041751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0076  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0025  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0024  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>