65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1456 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  92.9 
 
 
183 aa  344  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  91.26 
 
 
183 aa  334  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  59.02 
 
 
183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  41.11 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  40.56 
 
 
180 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  38.95 
 
 
189 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  31.38 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.5 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  31.22 
 
 
186 aa  92  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.3 
 
 
197 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.61 
 
 
184 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  25.23 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.32 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.46 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.44 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  31.41 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.05 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.4 
 
 
205 aa  60.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.6 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.13 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.13 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.13 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.32 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  30 
 
 
282 aa  51.6  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.67 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.11 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  28.41 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.56 
 
 
198 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.95 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.95 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.52 
 
 
216 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.37 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1016  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.87 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1146  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.87 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.92 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.92 
 
 
214 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1259  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.05 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000619005  normal  0.0127677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.26 
 
 
213 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.31 
 
 
214 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.71 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.3 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.95 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  25.74 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  25.74 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.38 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.71 
 
 
214 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.71 
 
 
214 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.71 
 
 
214 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 
213 aa  41.6  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2463  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.68 
 
 
216 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1159  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.17 
 
 
216 aa  41.2  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.51 
 
 
214 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
212 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>