16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0250 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0250  hypothetical protein  100 
 
 
44 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0801029  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09181  hypothetical protein  95.45 
 
 
44 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437722 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06801  hypothetical protein  65.91 
 
 
44 aa  70.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.7679  normal  0.526347 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09001  hypothetical protein  59.09 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0842  hypothetical protein  54.55 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218806  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09021  hypothetical protein  56.82 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10401  hypothetical protein  54.55 
 
 
44 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00434386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0668  hypothetical protein  47.5 
 
 
46 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0709263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3230  hypothetical protein  47.5 
 
 
40 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2890  hypothetical protein  47.5 
 
 
40 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4302  hypothetical protein  45 
 
 
40 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121294  normal  0.0877404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1447  hypothetical protein  66.67 
 
 
49 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2055  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0289  hypothetical protein  46.15 
 
 
48 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716816  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3812  hypothetical protein  45 
 
 
40 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0786  hypothetical protein  40 
 
 
40 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>