29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0087 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0087  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07111  hypothetical protein  97.75 
 
 
89 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.307453  normal  0.184917 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07581  hypothetical protein  67.21 
 
 
88 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.684319  hitchhiker  0.00863923 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12241  hypothetical protein  67.8 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0842  hypothetical protein  65.52 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.575835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1813  hypothetical protein  65.52 
 
 
113 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.929095  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06741  hypothetical protein  56.9 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0647  hypothetical protein  56.9 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07031  hypothetical protein  56.9 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07131  hypothetical protein  54.24 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2156  hypothetical protein  43.1 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11938  normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0521  hypothetical protein  41.38 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15471  hypothetical protein  38.98 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.218357  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05151  hypothetical protein  44.07 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18291  hypothetical protein  38.33 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.937629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0850  hypothetical protein  35 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0187131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4915  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3395  hypothetical protein  35 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1522  hypothetical protein  38.33 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16311  hypothetical protein  38.33 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16191  hypothetical protein  38.33 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0961  hypothetical protein  35 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13601  hypothetical protein  40.68 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  0.253214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0579  hypothetical protein  38.98 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2217  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.790768  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2109  hypothetical protein  35.82 
 
 
74 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2153  hypothetical protein  35.82 
 
 
74 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.733215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16071  hypothetical protein  30 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4489  hypothetical protein  29.85 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>