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for query gene PICST_87327 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_87327  multidrug resistance transporter  100 
 
 
554 aa  1129    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33820  multidrug resistance transporter  46.36 
 
 
476 aa  436  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0731367 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04840  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
466 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03580  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 
633 aa  262  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0622174  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07936  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01520)  33.97 
 
 
504 aa  256  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05628  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11060)  30.5 
 
 
592 aa  226  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.578894  normal  0.0253476 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10920  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
571 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.047229  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29843  dityrosine transporter A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  25 
 
 
469 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.323867  normal  0.166066 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02707  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 
478 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  27 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10951  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
502 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.566626  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05656  MFS multidrug resistance transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13660)  24.32 
 
 
568 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.481984 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04910  conserved hypothetical protein  22.11 
 
 
526 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.413844  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07070  dityrosine transporter, putative  23.51 
 
 
640 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06774  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11760)  24.5 
 
 
457 aa  99.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0399317  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02613  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00230)  23.65 
 
 
506 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774047 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06942  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10958  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05350)  22.22 
 
 
502 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02675  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01120)  24.15 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06019  conserved hypothetical protein  21.53 
 
 
483 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00615305 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00332  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 
523 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60920  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance multidrug resistance transporter  32 
 
 
569 aa  86.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00174903  normal  0.758845 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60062  spermidine exporter, MDR-type pump  23.38 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105172  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08122  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02700)  22.3 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11120  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03040)  23.59 
 
 
608 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0161613 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06928  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00489  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13830)  23.11 
 
 
552 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00739  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16320)  23.42 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06063  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08910)  24.83 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06477  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01930)  23.11 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0082392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.02 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07972  conserved hypothetical protein  21.83 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0939486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08610  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.08 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.6 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  31.18 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.12 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.81 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05220  membrane transport protein, putative  23.7 
 
 
595 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08210  hypothetical protein  25.7 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0889504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.73 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.22 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04817  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07120)  30.72 
 
 
731 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.891896 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05329  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.17 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00498  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02060)  20.45 
 
 
545 aa  67  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  31.22 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0399  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.83 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
592 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.92 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 
405 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  27.54 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.06 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 
405 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.24 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05369  conserved hypothetical protein  20.16 
 
 
538 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10207  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04702)  21.17 
 
 
573 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.91 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 
430 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 
405 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.07 
 
 
402 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  26.95 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.96 
 
 
402 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.06 
 
 
458 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.6 
 
 
402 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.67 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.78 
 
 
419 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.67 
 
 
416 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.67 
 
 
416 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.67 
 
 
416 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.78 
 
 
416 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.61 
 
 
395 aa  63.9  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.46 
 
 
478 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35133  major facilitator superfamily multidrug-resistance protein  23.18 
 
 
489 aa  63.5  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446888  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  26.95 
 
 
414 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01243  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10370)  21.41 
 
 
551 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  26.95 
 
 
414 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.06 
 
 
405 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.06 
 
 
405 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 
399 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
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NC_006685  CNC03290  tetracycline efflux protein, putative  24.37 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0454964  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  27.12 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.2 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.26 
 
 
398 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  30.68 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.76 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.07 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.78 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.94 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
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