More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81292 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81292  high-affinity permease for basic amino acids  100 
 
 
491 aa  984    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.958809 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02781  lysine transporter (Eurofung)  45.07 
 
 
519 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.641526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  40.65 
 
 
487 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  40.69 
 
 
487 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  38.14 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  38.14 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  38.14 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  38.68 
 
 
493 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1449  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 
507 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0168502  hitchhiker  0.00111111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  38.44 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1490  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 
507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819363  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 
514 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  38.31 
 
 
489 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  38.31 
 
 
489 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  38.31 
 
 
489 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  38.31 
 
 
489 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  38.28 
 
 
491 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  38.31 
 
 
489 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  37.95 
 
 
490 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  38.45 
 
 
533 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  37.42 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  37.21 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 
526 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  37.63 
 
 
510 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  37.42 
 
 
489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 
511 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  36.8 
 
 
511 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1757  lysine-specific permease transmembrane protein  36.97 
 
 
509 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  38.58 
 
 
511 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  37.53 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  37.37 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  36.52 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  35.91 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  38.33 
 
 
520 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  38.12 
 
 
520 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 
536 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 
526 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 
526 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 
511 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  38.22 
 
 
500 aa  299  7e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  37.66 
 
 
488 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  37.65 
 
 
526 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 
526 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 
520 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  36.72 
 
 
509 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 
520 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 
520 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  36.12 
 
 
526 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 
488 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  38.53 
 
 
488 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 
527 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  37.95 
 
 
488 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  37.95 
 
 
488 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 
493 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  37.72 
 
 
488 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  37.72 
 
 
488 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  37.72 
 
 
488 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  37.5 
 
 
489 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  37.72 
 
 
488 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  37.95 
 
 
488 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  37.72 
 
 
488 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  36.61 
 
 
510 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  35.84 
 
 
506 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  38.88 
 
 
496 aa  292  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 
497 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 
497 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 
491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  38.39 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  35.48 
 
 
489 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  34.08 
 
 
579 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  35.27 
 
 
489 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  34.76 
 
 
572 aa  281  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  35.62 
 
 
493 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  34.89 
 
 
575 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  36.83 
 
 
492 aa  280  5e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  37.18 
 
 
599 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  35.97 
 
 
496 aa  277  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  34.56 
 
 
479 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2751  amino acid permease-associated region  36.29 
 
 
505 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  34.97 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  37.24 
 
 
597 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  35.67 
 
 
589 aa  266  8e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  35.06 
 
 
552 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>