More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65696 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_65696  D-arabinitol 2-dehydrogenase [ribulose forming] (ARDH)  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  39.63 
 
 
355 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
258 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
251 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04691  D-arabinitol dehydrogenase (EC 1.1.1.250) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L8]  37.27 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
257 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
257 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  39.25 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 
255 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  38.01 
 
 
257 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01677  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08710)  35.66 
 
 
287 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
257 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
262 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
257 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
269 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
257 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  36.43 
 
 
261 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
257 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  37.36 
 
 
282 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
257 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  33.09 
 
 
337 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  34.96 
 
 
254 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
257 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.57 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.5 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  36.76 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08819  short chain dehydrogenase (Eurofung)  38.25 
 
 
294 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0173459  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.64 
 
 
277 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  35.69 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2259  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
262 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0792422  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
257 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00130  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 
302 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
258 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
252 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
255 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
257 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
257 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
239 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
255 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
255 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
255 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
255 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
256 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
255 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.23 
 
 
255 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.2 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
255 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08113  conserved hypothetical protein  39.56 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
255 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
263 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.96 
 
 
255 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
255 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.08 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 
254 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 
252 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.08 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  32.72 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
257 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
255 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
256 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
255 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03312  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G13830)  32.96 
 
 
249 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
262 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
257 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0087  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.09 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  32.72 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  32.72 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>