263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57331 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57331  adenosine kinase  100 
 
 
350 aa  709    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  55.81 
 
 
352 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  45.45 
 
 
347 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  45.56 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  45.99 
 
 
342 aa  268  8e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  24.14 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  25.47 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  27.35 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  28.45 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  25.07 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.91 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  24.93 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.51 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.74 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  25.36 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  25.71 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.61 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.61 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  26.65 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.78 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.78 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  24.21 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.47 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  23.82 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  26.57 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  24.84 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.49 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  26.7 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.61 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  24.57 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.16 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  26.29 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  25.93 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  25.4 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  26.98 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  25.07 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  25.07 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.03 
 
 
336 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.81 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  25.14 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  22.78 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  25.66 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  24.92 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  25.54 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  25 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  26.91 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.97 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.58 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  24.76 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.66 
 
 
312 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  24.79 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  26.09 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  21.75 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  25.8 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  24.32 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  25.08 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  25.32 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25 
 
 
304 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  24.68 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  25.4 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  23.55 
 
 
407 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  31.28 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  23.16 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  25.56 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  25.16 
 
 
308 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.36 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  33.8 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  24.62 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  26.71 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  25.77 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  25.48 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  24.8 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  24.43 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  23.35 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.05 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.77 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  25.4 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  24.15 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  24.46 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.74 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.74 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  27.1 
 
 
305 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.32 
 
 
312 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  40.74 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  40.74 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.65 
 
 
403 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  24.35 
 
 
328 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>