More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52982 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52982  methionyl-tRNA transformylase  100 
 
 		 348 aa  711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235194  normal  0.398719 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05738  methionyl-tRNA formyltransferase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06920)  36.11 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0711507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  32.64 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  31.61 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  25.67 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04140  methionyl-tRNA formyltransferase, putative  30.38 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  26.1 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  28.8 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  26.19 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  25.45 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  24.85 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  30.19 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  29.18 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 		 316 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  26.65 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  27.68 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  24.56 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  27.82 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  26.94 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  26.1 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  31.8 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  29.07 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  24.92 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  28.74 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  28.53 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  28.87 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  26.38 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2183  methionyl-tRNA formyltransferase  29.06 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  26.2 
 
 		 319 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  23.4 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  25.71 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  24.29 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  26.92 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  28.94 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  26.79 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  22.96 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  25.3 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  30.13 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  26.37 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  28.45 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  34.03 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  24.84 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  28.73 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  23.26 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  28.29 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  28.73 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  28.46 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1505  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.337969  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  26.36 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  28.22 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  23.97 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  26.18 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  28.36 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  33.93 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  26.72 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  24.56 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  27.84 
 
 		 312 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  27.24 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  27.13 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  29.44 
 
 		 333 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  27.61 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  25.51 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  27.97 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  27.99 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  29.2 
 
 		 305 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  26.38 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14917  predicted protein  32.64 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  28.74 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  26.77 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  27.2 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  27.99 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  26.07 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  25.19 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.99 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  27.24 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  27.6 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  32.85 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  26.69 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  25.15 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  23.47 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  27.4 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  28.27 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  26.59 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  23.66 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  25.19 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  26.97 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  25.87 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  26.02 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  27.12 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  28.33 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  27.02 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  26.9 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  26.91 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  25.19 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>