More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44069 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_44069  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  831    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.550726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06191  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11720)  34 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.662409  decreased coverage  0.00296342 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00900  cytoplasm protein, putative  28.71 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.957355  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  33.42 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  32.39 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 323 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 323 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.77 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.98 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 323 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  28.91 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  27.46 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  26.62 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  30.98 
 
 		 320 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  30.93 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  28.17 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.54 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  32.39 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.09 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  32.39 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  31.28 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.66 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  32.52 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  29.53 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.66 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  32.93 
 
 		 449 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  32.11 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  34 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  29.81 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  27.78 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  31.45 
 
 		 460 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  28.74 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  33.2 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  33.08 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  32.42 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.94 
 
 		 355 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  31.89 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  27.87 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  31.35 
 
 		 352 aa  130  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.27 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  27.08 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.54 
 
 		 365 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  27.12 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.79 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.87 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  32.94 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.27 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.27 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.27 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.33 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.04 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  31.23 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.87 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.27 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  28.26 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  31.64 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.36 
 
 		 325 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.83 
 
 		 357 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  28.78 
 
 		 350 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.87 
 
 		 316 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  28.12 
 
 		 358 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.47 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.52 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  28.68 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.47 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  29.07 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  27.05 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  28.46 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  30.04 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  29.85 
 
 		 346 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.79 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  29.64 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  29.13 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  30.19 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  28.32 
 
 		 323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  28.2 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  31.47 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  28.17 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.35 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>