More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33690 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_33690  Prephenate dehydratase (PDT)  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.748096  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11135  Prephenate dehydratase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q30KV5]  35.18 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.84 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.56 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.69 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.12 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  32.88 
 
 		 359 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.79 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.79 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.45 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.45 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  31.63 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  32.54 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.45 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  35.43 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.45 
 
 		 364 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.89 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.43 
 
 		 364 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.8 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.45 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.45 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.78 
 
 		 364 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.79 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  33 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  34.25 
 
 		 371 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  33.78 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  32.54 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.25 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.37 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.63 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  31.63 
 
 		 371 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  32.45 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  31.76 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.2 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.08 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  31.86 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  35.25 
 
 		 373 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.41 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  30.87 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.31 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  32.78 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  31.86 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.61 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.68 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.85 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  30.72 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  31.53 
 
 		 379 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.85 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  33.56 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  35.37 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  29.83 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  33.89 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  31.4 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  30.85 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  31.77 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  31.99 
 
 		 391 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.67 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  34.81 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  29.7 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  30.51 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  31.77 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  33.33 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.7 
 
 		 358 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  31.88 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  30.74 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.36 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  29.43 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  29.83 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  29.8 
 
 		 706 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  29.43 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  33 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  33.33 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.35 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  31.86 
 
 		 366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  28.86 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.06 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  30.74 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  30.43 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.74 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.39 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  29.15 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  31.92 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  29.97 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>